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分子動力分析為什么離不開分析互作儀

更新時間:2025-07-04點擊次數:33

一、動力學分析的核心需求 :捕捉動態相互作用

動力學分析的本質是研究分子、細胞或系統在時間維度上的行為變化,例如藥物與靶標蛋 白的結合速率、蛋白質折疊路徑、病毒與宿主受體的識別過程等。這類研究需要實時監測 分子間相互作用的動態參數,如結合常數(Kd)、解離速率(koff)、結合速率(kon)

等,而這些參數直接決定了生物過程的效率與機制。

傳統實驗方法(如熒光標記、放射性同位素法)存在標記干擾、耗時長、通量低等缺陷, 難以滿足復雜動態系統的分析需求。而分子互作儀通過無標記、實時監測的技術特性,成 為動力學分析的“核心工具"。例如,在藥物研發中,通過分子互作儀可精準量化抑制劑與  酶的結合動力學,預測藥物在體內的代謝半衰期。

分子互作儀的應用(1)

二、Gator Pro BLI儀器的技術革新

Gator Pro是由小鱷生物( Gator Bio)開發的高通量生物層干涉技術(BioLayer Interferometry, BLI )儀器,其技術優勢與動力學分析需求高度契合:

1. 無標記實時監測

BLI技術通過檢測生物分子結合時引起的微米級懸臂梁光學干涉信號變化,無需熒光 標記或放射性同位素,避免了標記物對分子天然構象的干擾。例如,在研究抗體-  原結合時,Gator Pro可直接監測完整抗體(含Fc段)與抗原的結合過程,而無需截 短或標記。

2. 高通量與自動化

Gator Pro支持96孔板高通量檢測,單次實驗可完成數百個樣本的動態分析,實驗效 率較傳統SPR技術提升5倍以上。其自動化的樣品加載與清洗系統,尤其適用于篩選  小分子化合物庫(如藥物先導物庫)的親和力與動力學參數。

3. 寬動態范圍與高靈敏度

該儀器可檢測低至納摩爾級(nM )的結合親和力,并能區分微秒級( μs)的結合時  間差異。例如,在酶抑制動力學研究中,Gator Pro可捕捉抑制劑與靶酶從快速結合 (kon=1e6 M-1s-1)到緩慢解離(koff=1e-4 s-1)的全過程。

GatorPrime分子互作儀

三、GatorPro在動力學分析中的典型應用

1. 藥物發現:從靶標驗證到優化

在新冠疫情期間,Gator Pro被用于篩選ACE2受體與病毒刺突蛋白的結合抑制劑。  通過動態分析藥物候選物的kon/koff值,科研團隊快速篩選出高選擇性化合物,縮短 3個月的實驗周期。此外,該儀器還可評估藥物分子對靶標蛋白構象的誘導效應, 指導結構優化。

2. 蛋白工程:揭示折疊與變構機制

研究團隊利用Gator Pro分析溶菌酶變構位點的動態特性,發現特定小分子可誘導酶構象變化,從而增強催化活性。此類數據為設計工程酶(如工業催化劑)提供了關 鍵動力學參數。

3. 免疫療法:評估免疫檢查點抑制劑

在PD-1/PD-L1抑制劑開發中,Gator Pro可量化腫瘤細胞表面PD-L1與T細胞受體的 結合動力學。實驗數據顯示,高親和力抑制劑(Kd<1nM)可顯著延長結合時間

(t1/2>24小時),從而增強抗腫瘤效果。

四、技術對比 : BLI vs. SPR vs. MST

技術

類型

核心

原理

動力學分析能力

適用場景

 

 

BLI

懸臂

梁光

學干 

實時監測結合/解離全

過程,支持納秒級時間

分辨率

大分子復合物、

膜蛋白、細胞表

面相互作用

 

 

SPR

表面

等離

子共 

 

依賴表面固定化,難以 區分結合與擴散效應

固定化分子(如 芯片表面蛋白)  的靜態親和力

 

MST

微量

熱泳 

通過熱變性曲線間接推

算結合參數,無法直接

獲取kon/koff

熱力學穩定性分 析、大分子復合 物解離能計算


  案例對比 :在EGFR抑制劑篩選中,SPR需固定化靶酶,可能破壞天然構象;而Gator Pro 可直接使用溶液態酶,獲得更接近生理條件的kon值(如1e5 M-1s-1 vs. 1e4 M-1s-1),指   導藥物優化。

分子互作儀參數

五、未來趨勢 :智能化與多技術融合

Gator Pro 2.0版本已集成AI算法,可自動識別結合事件并生成動力學模型。例如,通過機 器學習預測化合物對靶標蛋白的構象鎖定效應,將實驗周期從數周縮短至48小時。此外, 該儀器正與單細胞測序平臺聯用,研究腫瘤微環境中免疫細胞與腫瘤細胞的動態互作網

絡。

分子互作儀通過提供“動態視角"的分子相互作用數據,已成為現代動力學分析的重要工具。Gator Pro BLI儀器憑借其無標記、高通量、高靈敏度的技術特性,在藥物研發、蛋白工程等領域展現出其價值。隨著人工智能與多組學技術的融合,分子互作儀將進一 步推動從“靜態結構解析"到“動態過程調控"的研究范式轉變,為生命科學突破提供核心工  具支撐。

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